Y Combinatorは、株式と上限のないセーフティ・アグリーメント(Safe Agreement)と引き換えに、標準的な額の資金を投資します。参加企業は、製品開発と資金調達に向けた準備に重点を置いた3ヶ月間の集中プログラムに参加します。同社は、知識共有のための非公開ネットワーキング・プラットフォームへのアクセスを提供し、様々な分野の講演者を招いたイベントを開催しています。このプログラムの最後には、創業者たちが厳選された投資家グループに向けて自社のビジネスをプレゼンテーションするイベントが行われます。